小规模纳税在税务机关代开的普通发票不可以抵扣； 小规模纳税人在税务机关代开的增值税专用发票，如果你销售货物或者应税劳务给增值税一般纳税人，对方需要你开具增值税专用发票，但是你自己不能开具，那么你就需要到税务机关代开，这时作为对方是可以抵扣3％的进项税额，但是你自己是不能抵扣的，增值税专用发票的抵扣仅适用，增值税一般纳税人，作为小规模纳税人只能按照销售额和适用税率缴税。
小规模纳税人哪些税可以进项抵扣
《中华人民共和国增值税暂行条例》
第十一条
小规模纳税人销售货物或者应税劳务，实行按照销售额和征收率计算应纳税额的简易办法，并不得抵扣进项税额。应纳税额计算公式：
应纳税额=销售额×征收率
小规模纳税人的标准由国务院财政、税务主管部门规定。
小规模纳税人可以抵扣进项税吗
小规模纳税人一律不得抵扣增值税进项税鹅，但有一特例。自2004年12月1日起，增值税小规模纳税人购置税控收款机，经主管税务机关审核批准后，可凭购进税控收款机取得的增值税专用发票，按照发票上注明的增值税额，抵免当期应纳增值税。或者按照购进税控收款机取得的普通发票上注明的价款，依下列公式计算可抵免的税额：
可抵免的税额=价款/（1+17%）*17%当期应纳税额不足抵免的，未抵免的部分可在下期继续抵免。
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