增值税和企业所得税最大的区别是征税对象不同。
增值税一般归类为流转税，即针对货物、劳务或服务流转过程中的增值额征收；而企业所得税一般归类为所得税，是针对法人组织在一个特定会计期间内（一般为一个公历年度）的经营成果征收的所得税。通俗说，利润为正数才征企业所得税，无利润或利润为负数则不征所得税。当然这里的“利润”是指税收口径上的利润，一般情况下与会计口径上的利润并不一致。
增值税与企业所得税的纳税人不同。
经过几轮的“营改增”改革后，几乎所有的纳税人都是增值税的纳税人，所以增值税的纳税人覆盖面是最广的，只要发生经营行为，理论上都是增值税的纳税人。
企业所得税的纳税人是我国境内的企业和其他取得收入的组织，只有法人组织才需要交纳企业所得税，而例如自然人、一人独资企业、合伙企业则不交纳企业所得税，而是交纳个人所得税。
增值税与企业所得税的计算方式不同。
我国对增值税纳税人实行分类管理，分为小规模纳税人和一般纳税人。计税方式也分为一般计税方式和简易计税方式。一般纳税人主要采用一般计税方式，特定情况下可以采用简易计税方式；而小规模纳税人只能采用简易计税方式。
一般计税方式下，增值税应纳税额=当期销项税额-当期进项税额-上期留抵税额+当期进项税额转出额；简易计税方式下，增值税应纳税额=当期销售额×征收率。
企业所得税的计算方法分为直接法和间接法
直接法：应纳税所得额=收入总额-不征税收入-免税收入-各项扣除-弥补亏损（理论方法）
间接法：应纳税所得额=会计利润±纳税调整项目金额（实际方法）
增值税与企业所得税的征管方式不同。
增值税主要是以票控税，一般是按月申报（适用于一般纳税人）或按季申报（适用于小规模纳税人），基本上是按照开票收入和未开票收入填入申报表附表一对应栏次，同时将进项税额填入附表二，申报相对较简单。
企业所得税是以会计核算为基础，根据税收政策进行纳税调整，一般是按季预缴、年度汇算清缴，申报相对比较复杂。
差异一：增值税是“毛利税”，所得税是“净利润税”
例如：不含税销售300万，外购取得不含税专票100万，内部人工等支出100万，假设增值税税率为16%。那么（300-100）×16%=32元交的是增值税，这个200就是我们平常所知的“毛利”；（）=100×25%=25元交的是所得税，这个100元就是“净利润”（方便理解，假设所得税是国家的分红）。
差异二：增值税的算法是“价外税”，所得税的算法是“价内税” 1.算增值税的时候，假设小规模征收率3%。你收了103元，一开始国家就告诉你，100是你的收入，3元是你代收的。就如物业收了100元的物业费，顺便替电力公司代收3元的电费。从一开始就告诉你这个税不是从你的口袋拿钱，这3元和你无关，不是从你的收入里面扣，而是你额外代收。
2.算所得税的时候，假设100元的利润，所得税25元。这个就是实实在在的从你的口袋里面拿钱，本来是你的钱，国家分走25%。
差异三：增值税税率或征收率 与 所得税的税率不一样 1.增值税税率有16%，10%，6%（可以抵扣进项），征收率有3%和5%（不能抵扣进项）。
2.所得税的税率有25%（基本税率），20%（低税率），15%（优惠税率如高新），10%（实际执行税率，如符合条件的非居民所得税）。
差异四：增值税是“以票控税”，所得税是“以票算税” 1.增值税管理基本就是发票的管理，销售或者购进抵扣需要严格按照发票管理的规则来走。
2.所得税计算虽然以发票为基础，但是很多时候还涉及到内部凭证和其他票据如财政票据、税收凭证等。
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